Gintama The Final บอกเล่าเรื่องราวในช่วงเวลาที่โลกกำลังนับถอยหลังสู่การล่มสลาย กินโทกิ, ทาคาสุงิ และ คาซึระ ซึ่งเคยเป็นพันธมิตรกันมาก่อนจึงต้องกลับมาร่วมมือกันอีกครั้ง แต่แล้วพวกเขาก็ต้องเผชิญหน้ากับ อุซึโระ อีกหนึ่งบุคลิกของ โยชิดะ โชโย ซึ่งเป็นอาจารย์ที่เคยสั่งสอนพวกกินโทกิ กินโทกิและพรรคพวกจึงต้องพยายามทุกวิถีทางเพื่อหยุดยั้งวิกฤตในครั้งนี้ให้สำเร็จ