น้ำมะนาวประกอบด้วยกรดมาลิค กรดแอสคอร์บิก หรือวิตามินซี และกรดซิตริก ซึ่งกรดทั้งสามนี้มีประโยชน์ต่อร่างกายมากมายเช่น แก้ปากแห้ง บำรุงผิวพรรณ ขับแคลเซียมส่วนเกินออกจากหลอดเลือดแดง ตับอ่อน และไต
มะนาวมีสรรพคุณทางยามากมายมาย เช่น ช่วยบรรเทาอาการปวดศีรษะ วิงเวียน อาการไข้ อาการอ่อนเพลีย อาการคันตามผิวหนัง อาการคันจากรังแคและเชื้อราบนหนังศีรษะ กลากเกลื้อน โรคเหน็บชา อาการร้อนใน
มะนาวมีคุณสมบัติช่วยล้างสารพิษและลดไขมันในเลือด จึงช่วยควบคุมระดับไตรกลีเซอไรด์ให้เป็นปกติ และช่วยให้มีไขมันดีในร่างกายเพิ่มขึ้น จึงมีผู้ใช้มะนาวในการลดน้ำหนักอีกด้วย
นอกจากสรรพคุณและประโยชน์ในทางยาแล้ว มะนาวยังสามารถชำระล้างคราบสกปรกและรอยดำได้ ช่วยลดกลิ่นคาวปลา ป้องกันมอดขึ้นข้าวสาร ช่วยให้ไข่เจียวฟูขึ้น ป้องกันแมลงและสัตว์เลื้อยคลานมีพิษ
นอกจากนี้ยังมีความเชื่อผิดๆ เกี่ยวกับการใช้ประโยชน์จากมะนาวมากมาย ดังนั้นควรศึกษาให้ดีก่อนใช้ และรับประทานอาหารให้หลากหลายในปริมาณที่พอดีเพื่อรักษาสุขภาพให้แข็งแรง